LEBLOIS Raphael
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Raphaël LEBLOIS

Chargé de recherche, INRAE

Axe(s)

Responsabilité(s) collective(s)

Référent Développement durable

Mes recherches concernent principalement les développements méthodologiques en génétique des populations sur l’inférence de paramètres démographiques et historiques à partir de données génétiques en population naturelles et agronomiques. Je m’intéresse plus spécialement aux processus démographiques à petites échelles géographiques et évolutives, i.e. locaux et actuels ou relativement récent, notamment à l’estimation des caractéristiques de dispersion et des densités à l’échelle du paysage. Passé par les inférences par F-statistiques, puis par le maximum de vraisemblance, nous nous focalisons en ce moment sur l’utilisation de méthodes d’inférence basées sur la simulation qui permettent de considérer des modèles plus pertinent à ces échelles fines, par exemple avec des petites tailles de (sous-) populations (ou pas de sous-populations du tout pour les modèles d’isolement par la distance en habitat continu avec un individu par nœud du réseau). Plus récemment, j’ai commencé à m’intéresser aux processus adaptatifs à travers l’inférence des processus d’introgression adaptative.

 

Mots-clés : génétique/génomique des populations, inférence statistique, histoire démographique, dispersion, habitat continu, sous-population, inférence par simulation.

Dernières publications
Charbonnel E., Daguin-Thiebaut C., Caradec L., Moittie E., Gilg O., Gavrilo M.V., Strom H., Mallory M.L., Morrison R.I.G., Gilchrist H.G., Leblois R., Roux C., Yearsley J.M., Yannic G. & Broquet T. 2022. Searching for genetic evidence of demographic decline in an arctic seabird: beware of overlapping generations. Heredity 128 : 364-376. (https://dx.doi.org/10.1038/s41437-022-00515-3)
Gauffre B., Boissinot A., Quiquempois V., Leblois R., Grillet P., Morin S., Picard D., Ribout C. & Lourdais O. 2022. Agricultural intensification alters marbled newt genetic diversity and gene flow through density and dispersal reduction. Molecular Ecology 31 : 119-133. (https://dx.doi.org/10.1111/mec.16236)
Ledoux J.B., Ghanem R., Horaud M., López‐Sendino P., Romero‐Soriano V., Antunes A., Bensoussan N., Gómez‐Gras D., Linares C., Machordom A., Ocaña O., Templado J., Leblois R., Ben Souissi J. & Garrabou J. 2021. Gradients of genetic diversity and differentiation across the distribution range of a Mediterranean coral: Patterns, processes and conservation implications. Diversity and Distributions 27 : 2104-2123. (https://dx.doi.org/10.1111/ddi.13382)
Virgoulay* T., Rousset F., Noûs C. & Leblois R. 2021. GSpace: an exact coalescence simulator of recombining genomes under isolation by distance. Bioinformatics 37 : 3673-3675. (https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btab261)
Burban C., Rocha S., Leblois R., Rossi J.-P., Sauné L., Branco M. & Kerdelhué C. 2020. From sympatry to parapatry: a rapid change in the spatial context of incipient allochronic speciation. Evolutionary Ecology 34 : 101-121. (https://dx.doi.org/10.1007/s10682-019-10021-4)
Miralles A., Geniez P., Beddek M., Mendez-Aranda D., Brito J.C., Leblois R. & Crochet P.A. 2020. Morphology and multilocus phylogeny of the spiny-footed lizard (Acanthodactylus erythrurus) complex reveal two new mountain species from the Moroccan Atlas. Zootaxa 4747 : 302-326. (https://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4747.2.4)
Toyama K.S., Crochet P.-A. & Leblois R. 2020. Sampling schemes and drift can bias admixture proportions inferred by structure. Molecular Ecology Resources 20 : 1769-1785. (https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13234)