LEBLOIS Raphael
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Raphaël LEBLOIS

Chargé de recherche, INRAE

Axe(s)

Responsabilité(s) collective(s)

Référent Développement durable

Mes recherches concernent principalement les développements méthodologiques en génétique des populations sur l’inférence de paramètres démographiques et historiques à partir de données génétiques en population naturelles et agronomiques. Je m’intéresse plus spécialement aux processus démographiques à petites échelles géographiques et évolutives, i.e. locaux et actuels ou relativement récent, notamment à l’estimation des caractéristiques de dispersion et des densités à l’échelle du paysage. Passé par les inférences par F-statistiques, puis par le maximum de vraisemblance, nous nous focalisons en ce moment sur l’utilisation de méthodes d’inférence basées sur la simulation qui permettent de considérer des modèles plus pertinent à ces échelles fines, par exemple avec des petites tailles de (sous-) populations (ou pas de sous-populations du tout pour les modèles d’isolement par la distance en habitat continu avec un individu par nœud du réseau). Plus récemment, j’ai commencé à m’intéresser aux processus adaptatifs à travers l’inférence des processus d’introgression adaptative.

 

Mots-clés : génétique/génomique des populations, inférence statistique, histoire démographique, dispersion, habitat continu, sous-population, inférence par simulation.

Dernières publications
Charbonnel* E., Benoit L., Nidelet S., Ortega-Abboud E., Gschloessl B., Leblois R., Ouvrard D. & Chapuis M.-P. 2025. Optimization and evaluation of the bestRAD sequencing approach: towards ascertainment of the invasion routes of the oriental fruit fly, Bactrocera dorsalis. Molecular Ecology Resources 25 : e14114. (https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.14114)
Hobolth A., Boitard S., Futschik A. & Leblois R. 2025. A matrix-analytical sampling formula for time-homogeneous coalescent processes under the infinite sites mutation model. Theoretical Population Biology 163 : 62-79. (https://dx.doi.org/10.1016/j.tpb.2025.03.002)
Muller* T., Gautier M., Lombaert É., Leblois R., Sauné L., Branco M., Kerdelhué C. & Perrier C. 2025. Population Genomics of Incipient Allochronic Divergence in the Pine Processionary Moth. Molecular Ecology 34 : e70189. (https://dx.doi.org/10.1111/mec.70189)
Romieu* J., Camarata G., Crochet P.-A., de Navascués M., Leblois R. & Rousset F. 2025. Performance evaluation of adaptive introgression classification methods. Peer Community Journal 5 : e95. (https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.617)
Horaud M., Arizmendi-Meija R., Nebot-Colomer E., López-Sendino P., Antunes A., Dellicour S., Viard F., Leblois R., Linares C., Garrabou J. & Ledoux J.-B. 2024. Comparative population genetics of habitat-forming octocorals in two marine protected areas: eco-evolutionary and management implications. Conservation Genetics 25 : 319-334. (https://dx.doi.org/10.1007/s10592-023-01573-8)
Doniol‐Valcroze P., Rancilhac L., Brito J.C., Miralles A., Geniez P., Benoit L., Loiseau A., Leblois R., Dufresnes C. & Crochet P.A. 2023. Combining RADseq and contact zone analysis to decipher cryptic diversification in reptiles: Insights from the spiny‐footed lizard (Reptilia, Lacertidae). Zoologica Scripta 53 : 1-15. (https://dx.doi.org/10.1111/zsc.12628)
Fay R., Ficheux S., Béchet A., Besnard A., Crochet P.A., Leblois R., Crivelli A., Wattier R. & Olivier A. 2023. Direct and indirect estimates of dispersal support strong juvenile philopatry and male‐biased dispersal in a freshwater turtle species (Emys orbicularis). Freshwater Biology 68 : 2042-2053. (https://dx.doi.org/10.1111/fwb.14171)
Rancilhac L., Miralles A., Geniez P., Mendez-Aranda D., Beddek M., Brito J.C., Leblois R. & Crochet P.-A. 2023. Phylogeographic breaks and how to find them: An empirical attempt at separating vicariance from isolation by distance in a lizard with restricted dispersal. Peer Community Journal 3 : e74. (https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.301)
Charbonnel E., Daguin-Thiebaut C., Caradec L., Moittie E., Gilg O., Gavrilo M.V., Strom H., Mallory M.L., Morrison R.I.G., Gilchrist H.G., Leblois R., Roux C., Yearsley J.M., Yannic G. & Broquet T. 2022. Searching for genetic evidence of demographic decline in an arctic seabird: beware of overlapping generations. Heredity 128 : 364-376. (https://dx.doi.org/10.1038/s41437-022-00515-3)
Gauffre B., Boissinot A., Quiquempois V., Leblois R., Grillet P., Morin S., Picard D., Ribout C. & Lourdais O. 2022. Agricultural intensification alters marbled newt genetic diversity and gene flow through density and dispersal reduction. Molecular Ecology 31 : 119-133. (https://dx.doi.org/10.1111/mec.16236)