Sujet : Développement d’une version 3 opérationnelle du package DIYABC-RF
Dates : 1er juin 2026 – 30 juin 2027
Responsable CBGP : M. Gautier

Ce développement inclura 6 phases :

• Phase 1 : Débrancher le “training set simulator” originel de DIYABC ;
• Phase 2 : Brancher le simulator MS Prime et garder l’interface amont (définition des scenarios) er les analyses RF ;
• Phase 3 : Implémenter les sorties de MS Prime des résumés stats en C++ ;
• Phase 4 : Implémenter de nouveaux résumés statistiques décrivant les spectres de fréquence alléliques ;
• Phase 5 : Créer la documentation utilisateur ;
• Phase 6 : Applications/illustration (i) sur des datasetq “in-silico” dont on connait la vérité (i.e. simulés) pour illustrer le gain en terme d’inférence (model choice et estimation de parametres) d’une version 3 de DIYABC-RF incluant les phases 1 – 5, et (ii) sur des REAL dataset pour illustrations sur des cas concrets de génétique des populations (évolution des populations d’espèces envahissantes et des populations humaines).