Sujet : Diversité et histoire évolutive du symbionte bactérien Serratia symbiotica chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)
Dates : 1er octobre 2026 – 30 septembre 2029
Encadrement CBGP : E. Jousselin

Le projet de thèse de Moana Castanier vise à reconstruire l’histoire et les mécanismes de la diversification et de la spécialisation écologique chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum. À partir de données individuelles de séquençage de génomes entiers, le premier objectif consistera à reconstruire l’histoire de la diversification en combinant des approches de phylogéographie à l’échelle mondiale et des inférences démographiques. Ces analyses permettront de déterminer le rôle de l’adaptation à la plante hôte dans la diversification, de tester si les lignées spécialisées ont une origine unique ou multiple, et d’estimer la vitesse ainsi que le contexte de leur formation.

En complément des génomes nucléaires, l’analyse des génomes des endosymbiontes bactériens permettra de reconstituer l’histoire des associations entre les pucerons, leurs plantes hôtes et leurs endosymbiontes. Un deuxième objectif consistera à étudier les bases génétiques de l’adaptation à la plante hôte en utilisant comme cadres comparatifs : (i) des populations adaptées à différentes plantes hôtes et (ii) des populations adaptées à une même plante hôte mais d’origines géographiques distinctes en Europe de l’Ouest et en Asie centrale (réplicats biologiques). Enfin, un troisième objectif visera à développer une approche phylogénomique élargie au genre Acyrthosiphon afin d’évaluer si les patrons de spécialisation vis-à-vis des plantes hôtes se retrouvent également à cette échelle évolutive.