MARTIN Jean-Francois
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Jean-François MARTIN

Professeur, Institut Agro Montpellier

Axe(s)

Responsabilité(s) collective(s)

Directeur du département de Biologie et Ecologie (Institut Agro)
Référent Intégrité Scientifique
Délégué Science Ouverte

Je suis clairement focalisé aujourd’hui sur le fonctionnement des communautés d’Arthropodes, principalement dans les agrosystèmes, à travers l’étude des réseaux d’interaction écologiques au niveau des communautés d’Arthropodes/Plantes. Cette approche du fonctionnement des écosystèmes par l’intermédiaire de l’analyse des réseaux d’interaction permet d’adresser un grand nombre de questions posées dans le champ de l’écologie en général, de celui du contrôle biologique en particulier. Nous travaillons sur ces thématiques dans différents systèmes, à travers plusieurs programmes de recherche. Cette thématique est en pleine expansion, a beaucoup de potentiel et répond à la fois à des questionnements conceptuels centraux en Écologie mais aussi à des interrogations sociétales directement adressables.

Au delà de ces thèmes principaux je suis impliqué dans plusieurs projets impliquant l’utilisation et le développement de méthodologies basées sur le séquençage haut débit dans un cadre de caractérisation de la biodiversité (capture et séquançage de fragments longs, métagenomique 16S, séquençage d’amplicons, Génotypage par séquençage).

 

Mots-clés : Génomique environnementale

Dernières publications
Bendova B., Mikula O., Voslajerova Bimova B., Cizkova D., Daniszova K., Dureje L., Hiadlovska Z., Macholan M., Martin J.-F., Pialek J., Schmiedova L. & Kreisinger J. 2022. Divergent gut microbiota in two closely related house mouse subspecies under common garden conditions. FEMS Microbiology Ecology 98 : fiac078. (https://dx.doi.org/10.1093/femsec/fiac078)
Gilles A., Thevenin Y., Dione F., Martin J.-F., Barascud B., Chappaz R. & Pech N. 2022. Breaking the reproductive barrier of divergent species to explore the genomic landscape. Frontiers in Genetics 13 : 963341. (https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2022.963341)
Martin J.-C., Mesmin X., Buradino M., Rossi J.-P. & Kerdelhué C. 2022. Complex drivers of phenology in the pine processionary moth: lessons from the past. Agricultural and Forest Entomology 24 : 247-259. (https://dx.doi.org/10.1111/afe.12488)
Martin J.-C., Rossi J.-P., Buradino M. & Kerdelhué C. 2021. Monitoring of adult emergence in the pine processionary moth between 1970 and 1984 in Mont Ventoux, France. Biodiversity Data Journal 9 : e61086. (https://dx.doi.org/10.3897/BDJ.9.e61086)
Ollivier* M., Lesieur V., Tavoillot J., Bénetière F., Tixier M.S. & Martin J.F. 2021. An innovative approach combining metabarcoding and ecological interaction networks for selecting candidate biological control agents. Journal of Applied Ecology 58 : 2866-2880. (https://dx.doi.org/10.1111/1365-2664.14016)
Tavoillot J., Mateille T., Ali N., Chappé A.-M. & Martin J.-F. 2021. Early detection of the root-knot nematode Meloidogyne hapla through developing a robust qPCR approach compliant with the MIQE guidelines. Plant Disease 105 : 2836-2843. (https://dx.doi.org/10.1094/pdis-11-20-2408-re)
Bendova B., Pialek J., Dureje L., Schmiedova L., Cizkova D., Martin J.-F. & Kreisinger J. 2020. How being synanthropic affects the gut bacteriome and mycobiome: comparison of two mouse species with contrasting Écologies. BMC Microbiology 20 : 194. (https://dx.doi.org/10.1186/s12866-020-01859-8)
Matějková T., Hájková P., Stopková R., Stanko M., Martin J.-F., Kreisinger J. & Stopka P. 2020. Oral and vaginal microbiota in selected field mice of the genus Apodemus: a wild population study. Scientific Reports 10 : 13246. (https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-70249-x)
Ollivier M., Kazakou E., Corbin M., Sartori K., Gooden B., Lesieur V., Thomann T., Martin J.-F. & Tixier M.-S. 2020. Trait differentiation between native and introduced populations of the invasive plant Sonchus oleraceus L. (Asteraceae). Neobiota 55 : 85-115. (https://dx.doi.org/10.3897/neobiota.55.49158)
Ollivier M., Lesieur V., Raghu S. & Martin J.-F. 2020. Characterizing ecological interaction networks to support risk assessment in classical biological control of weeds. Current Opinion in Insect Science 38 : 40-47. (https://dx.doi.org/10.1016/j.cois.2019.12.002)