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Charles PERRIER

Chargé de recherche, INRAE

Axe(s)

Écologie et génétique évolutive des populations

Responsabilité(s) collective(s)

Groupe Animation Scientifique

J’utilise des approches de génétique et génomique des populations pour contribuer à comprendre les dynamiques démographiques, écologiques et évolutives de populations d’organismes vivant dans différents environnements, et pour participer à conseiller les gestionnaires de ces populations dans un contexte de changements globaux. J’analyse en particulier les dynamiques génomiques des empreintes de sélections positives et du fardeau, par exemple dans le cadre de l’expansion spatiale de populations et de petites populations isolées. J’étudie notamment des populations d’insectes (chenille processionnaire du pin, papillon de cendre) d’oiseaux (mésange) et de poissons (gambusie et le saumon atlantique).

Avant d’intégrer le CBGP à Montpellier en 2019, j’ai travaillé de 2015 à 2019 au CEFE à Montpellier, de 2011 à 2015 à l’Université Laval à Québec, et de 2007 à 2010 à DECOD à Rennes.

Mots-clés : génétique des populations, génomique, empreintes de sélection, adaptation, maladaptation, diversité génétique, taille efficace, flux de gènes, fardeau génétique, insectes, oiseaux, poissons, gestion

Di Lecce I., Perrier C., Szulkin M. & Sudyka J. 2023. Extra-pair paternity, breeding density, and synchrony in natural cavities versus nestboxes in two passerine birds. Ecology and Evolution 13 : e10163. (https://dx.doi.org/10.1002/ece3.10163)

Andrello M., D'Aloia C., Dalongeville A., Escalante M.A., Guerrero J., Perrier C., Torres-Florez J.P., Xuereb A. & Manel S. 2022. Evolving spatial conservation prioritization with intraspecific genetic data. Trends in Ecology & Evolution 37 : 553-564. (https://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2022.03.003)

Caizergues A.E., Le Luyer J., Grégoire A., Szulkin M., Senar J.C., Charmantier A. & Perrier C. 2022. Epigenetics and the city: non‐parallel DNA methylation modifications across pairs of urban‐rural Great tit populations. Evolutionary Applications 15 : 149-165. (https://dx.doi.org/10.1111/eva.13334)

Miller J.M., Garant D., Perrier C., Juette T., Jameson J.W., Normandeau E., Bernatchez L. & Réale D. 2022. Linking genetic, morphological, and behavioural divergence between inland island and mainland deer mice. Heredity 128 : 97-106. (https://dx.doi.org/10.1038/s41437-021-00492-z)

Rougemont Q., Perrier C., Besnard A.L., Lebel I., Abdallah Y., Feunteun E., Reveillac E., Lasne E., Acou A., Nachon D.J., Cobo F., Evanno G., Bagliniere J.L. & Launey S. 2022. Population genetics reveals divergent lineages and ongoing hybridization in a declining migratory fish species complex. Heredity 129 : 137-151. (https://dx.doi.org/10.1038/s41437-022-00547-9)

Urvois* T., Perrier C., Roques A., Sauné L., Courtin C., Li Y., Johnson A.J., Hulcr J., Auger-Rozenberg M.-A. & Kerdelhué C. 2022. The phylogeography of the worldwide invader Xylosandrus compactus revealed using COI and RAD sequencing analyses. Journal of Pest Science 95 : 1217-1231. (https://dx.doi.org/10.1007/s10340-021-01443-7)

Lennox R.J., Alexandre C.M., Almeida P.R., Bailey K.M., Barlaup B.T., Bøe K., Breukelaar A., Erkinaro J., Forseth T., Gabrielsen S.-E., Halfyard E., Hanssen E.M., Karlsson S., Koch S., Koed A., Langåker R.M., Lo H., Lucas M.C., Mahlum S., Perrier C., Pulg U., Sheehan T., Skoglund H., Svenning M., Thorstad E.B., Velle G., Whoriskey F.G., Vollset K.W. & Grabowski J. 2021. The quest for successful Atlantic salmon restoration: perspectives, priorities, and maxims. ICES Journal of Marine Science 78 : 3479-3497. (https://dx.doi.org/10.1093/icesjms/fsab201)

Rougemont Q., Dolo V., Oger A., Besnard A.-L., Huteau D., Coutellec M.-A., Perrier C., Launey S. & Evanno G. 2021. Riverscape genetics in brook lamprey: genetic diversity is less influenced by river fragmentation than by gene flow with the anadromous ecotype. Heredity 126 : 235-250. (https://dx.doi.org/10.1038/s41437-020-00367-9)

Escalante M.A., Perrier C., García-De León F.J., Ruiz-Luna A., Ortega-Abboud E. & Manel S. 2020. Genotyping-by-sequencing reveals the effects of riverscape, climate and interspecific introgression on the genetic diversity and local adaptation of the endangered Mexican golden trout (Oncorhynchus chrysogaster). Conservation Genetics 21 : 907-926. (https://dx.doi.org/10.1007/s10592-020-01297-z)

Lambrechts M.M., Caizergues A.E., Perrier C., Charmantier A. & Caro S.P. 2020. Surface temperatures of non-incubated eggs in great tits (Parus major) are strongly associated with ambient temperature. International Journal of Biometeorology 64 : 1767-1775. (https://dx.doi.org/10.1007/s00484-020-01958-1)