PERRIER C - cbgp

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Charles PERRIER

Chargé de recherche, INRAE

Axe(s)

Écologie et génétique évolutive des populations

Responsabilité(s) collective(s)

Groupe Animation Scientifique

J’utilise des approches de génétique et génomique des populations pour contribuer à comprendre les dynamiques démographiques, écologiques et évolutives de populations d’organismes vivant dans différents environnements, et pour participer à conseiller les gestionnaires de ces populations dans un contexte de changements globaux. J’analyse en particulier les dynamiques génomiques des empreintes de sélections positives et du fardeau, par exemple dans le cadre de l’expansion spatiale de populations et de petites populations isolées. J’étudie notamment des populations d’insectes (chenille processionnaire du pin, papillon de cendre) d’oiseaux (mésange) et de poissons (gambusie et le saumon atlantique).

Avant d’intégrer le CBGP à Montpellier en 2019, j’ai travaillé de 2015 à 2019 au CEFE à Montpellier, de 2011 à 2015 à l’Université Laval à Québec, et de 2007 à 2010 à DECOD à Rennes.

Mots-clés : génétique des populations, génomique, empreintes de sélection, adaptation, maladaptation, diversité génétique, taille efficace, flux de gènes, fardeau génétique, insectes, oiseaux, poissons, gestion

Sudyka J., Di Lecce I., Hebda G., Rowiński P., Rutkowski R., Szczuka A., Perrier C., Cholewa M., Maziarz M., Wesołowski T. & Szulkin M. 2026. Avian extra‐pair paternity in the last European primeval forest. Functional Ecology 40 : 338-346. (https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.70223)

Thompson M.J., Gervais L., Bharath D., Caro S.P., Chaine A.S., Perrier C., Reale D. & Charmantier A. 2025. Tit wit: environmental and genetic drivers of cognitive variation along an urbanization gradient. Animal Cognition 28 : 56. (https://dx.doi.org/10.1007/s10071-025-01962-1)

Perrier C., Allio R., Legeai F., Gautier M., Beneluz F., Marande W., Theron A., Rodde N., Herrera M., Sauné L., Parrinello H., McClure M. & Arias M. 2025. Transposable element accumulation drives genome size increase in Hylesia metabus (Lepidoptera: Saturniidae), an urticating moth species from South America. Journal of Heredity 116 : 344-353. (https://dx.doi.org/10.1093/jhered/esae069)

Muller* T., Gautier M., Lombaert É., Leblois R., Sauné L., Branco M., Kerdelhué C. & Perrier C. 2025. Population Genomics of Incipient Allochronic Divergence in the Pine Processionary Moth. Molecular Ecology 34 : e70189. (https://dx.doi.org/10.1111/mec.70189)

Dumas K., Marais G., Paitreault S., Avrillier J.-N., Rosa A., Hedde M., Rasplus J.-Y., Chérasse S., Ouvrard D., Reynaud P., Trap J., Filali Alaoui I., Noël F., Perrier C., Yannic G., Gallet C., Bernier N., Lavergne S. & Ibanez S. 2025. Cushion plants in the Alps are swarming with invertebrate life. Alpine Botany 135 : 203-214. (https://dx.doi.org/10.1007/s00035-025-00335-1)

Arias M., Ninnin P., Ten Hoopen M., Alvarado J., Cabezas Huayllas O., Valderrama B., Alguilar G., Perrier C., Dedieu F. & Bagny Beilhe L. 2025. The American cocoa pod borer, Carmenta foraseminis, an emerging pest of cocoa: A review. Agricultural and Forest Entomology 27 : 340-356. (https://dx.doi.org/10.1111/afe.12676)

Arias M., Behrendt L., Dressler L., Raka A., Perrier C., Elias M., Gomez D., Renoult J.P. & Tedore C. 2025. Testing the equivalency of human "predators" and deep neural networks in the detection of cryptic moths. Journal of Evolutionary Biology 38 : 214-224. (https://dx.doi.org/10.1093/jeb/voae146)

Hoste A., Capblancq T., Broquet T., Denoyelle L., Perrier C., Buzan E., Sprem N., Corlatti L., Crestanello B., Hauffe H.C., Pellissier L. & Yannic G. 2024. Projection of current and future distribution of adaptive genetic units in an alpine ungulate. Heredity 132 : 54-66. (https://dx.doi.org/10.1038/s41437-023-00661-2)

Di Lecce I., Sudyka J., Perrier C. & Szulkin M. 2024. Extra-pair paternity in two passerine birds breeding in a gradient of urbanisation. Molecular Ecology 33 : e17481. (https://dx.doi.org/10.1111/mec.17481)

Charmantier A., Burkhard T., Gervais L., Perrier C., Schulte‐Hostedde A.I. & Thompson M.J. 2024. How does urbanization affect natural selection?. Functional Ecology 38 : 2522-2536. (https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.14667)