Responsabilité(s) collective(s)
Sujet : Phylogénomique des charançons pollinisateurs de couvain en zone tropicale.
École doctorale : Université de Montpellier, GAIA
Dates : 1er octobre 2023 – 30 septembre 2026
Encadrants CBGP : R. Allio & J. Haran
Benjamin effectue sa thèse au CBGP encadré par Rémi Allio (INRAE) et Julien Haran (Cirad), sous la direction de Benoît Nabholz (ISEM). Il s’intéresse à l’évolution des intéractions entre les plantes et les charançons, comme les changements de plante-hôte et les systèmes de pollinisation de couvain (brood-site), en utilisant une approche phylogénomique. En particulier, de récents travaux ont montré l’implication d’un genre (Endaeus) dans des systèmes de pollinisation de couvain de plusieurs familles botaniques en zone tropicale. Par son extrême diversité et sa large gamme d’hôtes, ce genre est un modèle de choix pour étudier à la fois un groupe taxonomique et un mode de pollinisation encore méconnus.
Dans un premier temps, une étude de génomique comparative sera conduite sur une dizaine de génomes de charançons générés par le “Darwin Tree of Life” et l’équipe d’accueil. Un nouvel ensemble de locus sera alors sélectionné pour être phylogénétiquement informatif à l’échelle de ce groupe de charançons. Dans un second temps, une étude phylogénomique sera menée sur une centaine d’espèces d’Endaeus pour répondre aux problématiques de la thèse dans un contexte plus général d’évolution des intéractions mutualistes.
Mots-clés : charançon, évolution des intéractions, phylogénomique, pollinisation