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Candidature spontanée

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Réf. : 10

Thèse IFIGS

Le CBGP ouvre une thèse de doctorat

Inférer les flux de populations du ravageur invasif Bactrocera dorsalis, en soutien à la gestion et à la surveillance.

Originaire d’Asie, la mouche orientale des fruits, Bactrocera dorsalis, représente une menace majeure pour l’arboriculture dans les nouveaux territoires envahis. Dans le cadre des projets BacTrack et Disland, notre consortium de recherche a acquis un important jeu de données de génomique et de dynamique des populations sur le continent africain, ce qui offre l’opportunité d’étudier certaines caractéristiques de cette invasion biologique.

Dans ce contexte, le travail de thèse consistera à mettre en œuvre des approches de modélisation innovantes pour (1) reconstruire les voies historiques d’invasion du continent africain en intégrant la possibilité d’évènements d’hybridation interspécifique, soupçonnés avec certaines espèces du même clade phylogénétique ; (2) évaluer le rôle de la dispersion à longue distance par les vents et les transports dans l’établissement de dynamiques sources-puits favorables aux ré-infestations annuelles des vergers en Afrique de l’Ouest ; et (3) déterminer les rôles respectifs de la dispersion active à courte distance et de la dispersion passive à longue distance dans la ré-infestation précoce des vergers du bassin de production sénégalais de la région des Niayes situé en zone sahélienne où les conditions environnementales sont défavorables au maintien continu de B. dorsalis. La caractérisation des flux de populations de B. dorsalis à de multiples échelles du continent africain permettra d’optimiser les pratiques de gestion dans les territoires envahis et d’orienter la surveillance dans les territoires où l’espèce est en priorité de quarantaine, notamment en France.

Direction : Arnaud Estoup (INRAE-CBGP) & Claire Garros (CIRAD-ASTRE)

Encadrement : Marie-Pierre Chapuis (CIRAD-CBGP) & Karine Berthier (INRAE-PV/CBGP)

Description complète et modalités de candidature : suivre ce lien

A : La mouche orientale des fruits, Bactrocera dorsalis (© Antoine Franck, Cirad) et B : son aire de répartition (carte adaptée à partir de la base de données de l’Organisation Européenne et Méditerranéenne pour la Protection des Plantes (EPPO), mise à jour avril 2023)
Type de poste

Contrat de doctorant, 3 ans.

Réf. : 10

Thèse IFIGS

Le CBGP ouvre une thèse de doctorat

Inférer les flux de populations du ravageur invasif Bactrocera dorsalis, en soutien à la gestion et à la surveillance.

Originaire d’Asie, la mouche orientale des fruits, Bactrocera dorsalis, représente une menace majeure pour l’arboriculture dans les nouveaux territoires envahis. Dans le cadre des projets BacTrack et Disland, notre consortium de recherche a acquis un important jeu de données de génomique et de dynamique des populations sur le continent africain, ce qui offre l’opportunité d’étudier certaines caractéristiques de cette invasion biologique.

Dans ce contexte, le travail de thèse consistera à mettre en œuvre des approches de modélisation innovantes pour (1) reconstruire les voies historiques d’invasion du continent africain en intégrant la possibilité d’évènements d’hybridation interspécifique, soupçonnés avec certaines espèces du même clade phylogénétique ; (2) évaluer le rôle de la dispersion à longue distance par les vents et les transports dans l’établissement de dynamiques sources-puits favorables aux ré-infestations annuelles des vergers en Afrique de l’Ouest ; et (3) déterminer les rôles respectifs de la dispersion active à courte distance et de la dispersion passive à longue distance dans la ré-infestation précoce des vergers du bassin de production sénégalais de la région des Niayes situé en zone sahélienne où les conditions environnementales sont défavorables au maintien continu de B. dorsalis. La caractérisation des flux de populations de B. dorsalis à de multiples échelles du continent africain permettra d’optimiser les pratiques de gestion dans les territoires envahis et d’orienter la surveillance dans les territoires où l’espèce est en priorité de quarantaine, notamment en France.

Direction : Arnaud Estoup (INRAE-CBGP) & Claire Garros (CIRAD-ASTRE)

Encadrement : Marie-Pierre Chapuis (CIRAD-CBGP) & Karine Berthier (INRAE-PV/CBGP)

Description complète et modalités de candidature : suivre ce lien

A : La mouche orientale des fruits, Bactrocera dorsalis (© Antoine Franck, Cirad) et B : son aire de répartition (carte adaptée à partir de la base de données de l’Organisation Européenne et Méditerranéenne pour la Protection des Plantes (EPPO), mise à jour avril 2023)
Type de poste

Contrat de doctorant, 3 ans.

Candidature spontannée

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