CHARBONNEL N

nathalie.charbonnel@inrae.fr

+33 4 99 62 33 02

All members

Nathalie CHARBONNEL

Research Director, INRAE

Area(s)

Ecology and evolution of zoonoses

Collective responsibility(ies)

Head of Area 3

Mes recherches en écologie de la santé ont pour thématique générale les interactions entre petits mammifères (rongeurs, insectivores, chirpotères) et pathogènes. Elles visent à décrire ces interactions, leur variabilité dans le temps et l’espace, et à comprendre les mécanismes écologiques qui régissent leur évolution. Dans le cadre de l’étude des zoonoses et des risques d’émergence, je m’attache à caractériser les réservoirs et les agents de zoonoses, à analyser les processus macro- et microévolutifs qui façonnent la diversité des interactions réservoirs/pathogènes, et à évaluer l’impact des coinfections et des flores microbiennes sur la sensibilité des petits mammifères à certains pathogènes potentiellement zoonotiques. Je développe ces recherches dans le cadre de projets pluri- et trans-disciplinaires afin de co-construire des stratégies de gestion des petits mammifères qui soient ‘gagnant-gagnant’ pour la conservation de la biodiversité et pour la santé publique.

Mots-clés : zoonoses, écologie de la santé, rongeurs, mammifères.

Poissenot K., Moussu C., Brachet M., Chesneau D., Chemineau P., Laine A.L., Migaud M., Charbonnel N. & Keller M. 2023. Population density does not affect seasonal regulation of reproductive physiology in male water voles. Biology Letters 19 : 20220441. (https://dx.doi.org/10.1098/rsbl.2022.0441)

Zintl A., McManus A., Galan M., Diquattro M., Giuffredi L., Charbonnel N., Gray J., Holland C. & Stuart P. 2023. Presence and identity of Babesia microti in Ireland. Ticks and Tick-Borne Diseases 14 : 102221. (https://dx.doi.org/10.1016/j.ttbdis.2023.102221)

Bouilloud* M., Galan M., Dubois A., Diagne C., Marianneau P., Roche B. & Charbonnel N. 2023. Three-way relationships between gut microbiota, helminth assemblages and bacterial infections in wild rodent populations. Peer Community Journal 3 : e18. (https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.243)

Pradel J., Bouilloud* M., Loiseau A., Piry S., Galan M., Artige E., Castel G., Ferrero J., Gallet R., Thuel G., Vieira N. & Charbonnel N. 2022. Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10 : e95214. (https://dx.doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214)

Bourret V., Dutra L., Alburkat H., Maki S., Lintunen E., Wasniewski M., Kant R., Grzybek M., Venkat V., Asad H., Pradel J., Bouilloud* M., Leirs H., Colombo V.C., Sluydts V., Stuart P., McManus A., Eccard J.A., Firozpoor J., Imholt C., Nowicka J., Goll A., Ranc N., Castel G., Charbonnel N. & Sironen T. 2022. Serologic surveillance for SARS-CoV-2 infection among wild rodents, Europe. Emerging Infectious Diseases 28 : 2577-2580. (https://dx.doi.org/10.3201/eid2812.221235)

Vulin J., Murri S., Madrières* S., Galan M., Tatard C., Piry S., Vaccari G., D’Agostino C., Charbonnel N., Castel G. & Marianneau P. 2021. Isolation and genetic characterization of Puumala Orthohantavirus strains from France. Pathogens 10 : 349. (https://dx.doi.org/10.3390/pathogens10030349)

Tournayre* O., Leuchtmann M., Galan M., Trillat M., Piry S., Pinaud D., Filippi‐Codaccioni O., Pontier D. & Charbonnel N. 2021. eDNA metabarcoding reveals a core and secondary diets of the greater horseshoe bat with strong spatio‐temporal plasticity. Environmental DNA 3 : 277-296. (https://dx.doi.org/10.1002/edn3.167)

Quéméré E., Hessenauer P., Galan M., Fernandez M., Merlet J., Chaval Y., Morellet N., Verheyden H., Gilot‐Fromont E. & Charbonnel N. 2021. Pathogen‐mediated selection favours the maintenance of innate immunity gene polymorphism in a widespread wild ungulate. Journal of Evolutionary Biology 34 : 1156-1166. (https://dx.doi.org/10.1111/jeb.13876)

Tournayre O., Leuchtmann M., Filippi-Codaccioni O., Trillat M., Piry S., Pontier D., Charbonnel N. & Galan M. 2020. In silico and empirical evaluation of twelve metabarcoding primer sets for insectivorous diet analyses. Ecology and Evolution 10 : 6310-6332. (https://dx.doi.org/10.1002/ece3.6362)

Murri S., Madrières S., Tatard C., Piry S., Benoit L., Loiseau A., Pradel J., Artige E., Audiot P., Leménager N., Lacôte S., Vulin J., Charbonnel N., Marianneau P. & Castel G. 2020. Detection and genetic characterization of Puumala Orthohantavirus S-segment in areas of France non-endemic for Nephropathia Epidemica. Pathogens 9 : 721. (https://dx.doi.org/10.3390/pathogens9090721)