Sujet : Génomique du fardeau de la processionnaire du pin
Dates : 15 novembre 2022 – 31 mars 2026
Responsables CBGP : C. Perrier, M. Gautier & C. Kerdelhué
Université : Université de Montpellier, ED GAIA
L’expansion spatiale et démographique des espèces dans des contextes de changement climatique et/ou d’invasions est supposée déclencher l’épuisement de la diversité génétique, l’augmentation de la consanguinité et influencer les processus d’adaptation et de purge-accumulation du fardeau génétique.
L’objectif de ma thèse est de tester ces hypothèses dans le contexte de l’expansion de la processionnaire en Europe. Pour ce faire, j’analyserai des données génomiques (WGS individuel et Poolseq) de la processionnaire du pin de plusieurs populations se situant à différents endroits le long de l’aire d’expansion.
J’estimerai la diversité génétique, la consanguinité, les proxys du fardeau génétique et les empreintes génomiques putatives de l’adaptation et testerai les hypothèses liées à l’adaptation et à la purge-accumulation de la charge génétique lors de l’expansion spatiale.