Sujet : Génomique évolutive des pyrales du genre Ostrinia
Responsable CBGP : R. Streiff
Dates : 1er janvier 2023 – 28 février 2025

Mes travaux portent sur la génomique évolutive de populations d’arthropodes. Au CBGP, je suis en charge de l’analyse de données de séquences haut-débit de trois espèces de pyrales du genre Ostrinia en Europe et en Asie. En Europe, je cherche à identifier des régions génomiques impliquées dans la divergence entre les deux espèces inféodées au maïs d’une part et à une gamme de dicotylédones sauvages d’autre part, et de mesurer les variations de cette divergence en Europe de l’Ouest. Je produis également un nouvel assemblage de génome « longs fragments » pour l’une des espèces et mène une analyse comparative de la divergence et de la convergence entre Europe et Asie, où deux espèces du genre ont colonisé indépendamment le maïs, plante introduite dans ces deux régions géographiques il y a environ 500 ans.

Je suis prolongé en CDD au CBGP du 1er juillet 2024 au 28 février 2025. Je réaliserai des analyses génomiques dans un ensemble de populations de processionnaires du pin. Il s’agira notamment d’étudier les processus d’adaptation/maladaptation dans un contexte d’expansion de la pyrale et éventuellement de creuser les mécanismes génétiques d’un cas présumé de résistance aux insecticides. Mon encadrant est Charles Perrier.

Mots-clés : génomique évolutive, adaptation, spéciation, bio-informatique