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Anne-Laure CLAMENS

Technicienne, INRAE

Axe(s)

Caractérisation et évolution de la biodiversité

Plateau(x) technique(s)

Biologie Moléculaire

Responsabilité(s) collective(s)
Animatrice PT BM
Responsable de l’évacuation des déchets chimiques
Membre du groupe Développement Durable

Je suis technicienne en biologie moléculaire et j’anime le plateau technique de biologie moléculaire. Je suis responsable de l’évacuation des déchets chimiques générés par le plateau.

Je travaille avec Gael Kergoat et Emmanuelle Jousselin, deux directeurs de recherche du CBGP respectivement SPE et ECODIV.

Mon travail est centré sur des approches de biologie moléculaire pour produire des données génétiques nécessaires aux études de phylogénétique/phylogénomique, de génomique, et de barcoding/metabarcoding. Je travaille principalement sur modèle insecte (pucerons, coléoptères, névroptères et lépidoptères).

J’utilise les technologies Illumina pour développer des protocoles de séquençage haut débit :

séquençage du 16S bactérien sur MiSeq pour identifier les endosymbiontes des pucerons (Wolbachia, Serratia…).
séquençage d’amplicons (COI, 12S) sur MiSeq sur plusieurs groupes d’espèces de coléoptères (Tenebrionidae, névroptères)
séquençage shot gun sur NovaSeq pour obtenir les génomes entiers de plusieurs espèces de coléoptères (Spodoptera, bruches…)

Une autre partie de mon travail est allouée au plateau BM, avec notamment l’animation et la gestion des déchets et je m’investis également dans le groupe Développement Durable du CBGP.

Mots-clés : Biologie moléculaire, barcoding, phylogéni.

Manzano-Marín A., Coeur d’acier A., Clamens A.-L., Cruaud C., Barbe V. & Jousselin E. 2023. Co-obligate symbioses have repeatedly evolved across aphids, but partner identity and nutritional contributions vary across lineages. Peer Community Journal 3 : e46. (https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.278)

Le Ru B., Hévin N.M.-C., Capdevielle-Dulac C., Musyoka B.K., Sezonlin M., Conlong D., Van Den Berg J., Ndemah R., Le Gall P., Cugala D., Nyamukondiwa C., Pallangyo B., Njaku M., Goftishu M., Assefa Y., Bani G., Molo R., Chipapika G., Ong’amo G., Clamens A.-L., Barbut J. & Kergoat G.J. 2022. Phylogenetics, integrative taxonomy and systematics of the Sesamia cretica Lederer, 1857 species group (Lepidoptera: Noctuidae: Apameini: Sesamiina), with the description of 21 new species from the Afrotropical region. Annales de la Société entomologique de France (NS) 58 : 387-454. (https://dx.doi.org/10.1080/00379271.2022.2113341)

Yainna S., Tay W.T., Durand K., Fiteni E., Hilliou F., Legeai F., Clamens A.-L., Gimenez S., Asokan R., Kalleshwaraswamy C.M., Deshmuk S., Meagher J., R.L., Blanco C.A., Silvie P., Brévault T., Dassou A., Kergoat G.J., Walsh T., Gordon K., Nègre N., d'Alençon E. & Nam K. 2022. The evolutionary process of biological invasion in the fall armyworm (Spodoptera frugiperda). Scientific Reports 12 : 25529. (https://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-25529-z)

Allio R., Nabholz B., Wanke S., Chomicki G., Pérez-Escobar O.A., Cotton A.M., Clamens A.-L., Kergoat G.J., Sperling F.A.H. & Condamine F.L. 2021. Genome-wide macroevolutionary signatures of key innovations in butterflies colonizing new host plants. Nature Communications 12 : 354. (https://dx.doi.org/10.1038/s41467-020-20507-3)

Kergoat G.J., Goldstein P.Z., Le Ru B., Meagher Jr R.L., Zilli A., Mitchell A., Clamens A.-L., Gimenez S., Barbut J., Nègre N., d'Alençon E. & Nam K. 2021. A novel reference dated phylogeny for the genus Spodoptera Guenée (Lepidoptera: Noctuidae: Noctuinae): new insights into the evolution of a pest-rich genus. Molecular Phylogenetics and Evolution 161 : 107161. (https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107161)

Sarr* O.M., Garba M., Bal A.B., Hima K., Ndiaye M., Fossoud A., Clamens A.-L., Tavoillot J. & Gauthier N. 2021. Strain composition and genetic diversity of the fall armyworm Spodoptera frugiperda (Lepidoptera, Noctuidae): new insights from seven countries in West Africa. International Journal of Tropical Insect Science 41 : 2695-2711. (https://dx.doi.org/10.1007/s42690-021-00450-6)

Allio R., Scornavacca C., Nabholz B., Clamens A.-L., Sperling F.A. & Condamine F.L. 2020. Whole genome shotgun phylogenomics resolves the pattern and timing of swallowtail butterfly evolution. Systematic Biology 69 : 38-60. (https://dx.doi.org/10.1093/sysbio/syz030)

Le Ru B., Capdevielle-Dulac C., Musyoka B.K., Sezonlin M., Conlong D., Van Den Berg J., Clamens A.-L., Cugala D., Nyamukondiwa C., Ong’Amo G. & Kergoat G.J. 2020. Phylogeny and systematics of the Sesamia coniota Hampson species group (Lepidoptera: Noctuidae: Noctuinae: Apameini: Sesamiina), with the description of three new species from the Afrotropical region. Annales de la Société entomologique de France (NS) 56 : 417-435. (https://dx.doi.org/10.1080/00379271.2020.1815574)

Manzano-Marin A., Coeur d'acier A., Clamens A.-L., Orvain C., Cruaud C., Barbe V. & Jousselin E. 2020. Serial horizontal transfer of vitamin-biosynthetic genes enables the establishment of new nutritional symbionts in aphids' di-symbiotic systems. The ISME Journal 14 : 259-273. (https://dx.doi.org/10.1038/s41396-019-0533-6)