Mon activité principale consiste à développer et mettre en place des stratégies moléculaires d’étude de la variabilité génétique des populations naturelles de vertébrés, de leurs pathogènes ainsi que de proies associées, à partir d’échantillons invasifs ou d’ADN environnemental. Ces méthodes concernent la caractérisation de séquences nucléiques, de génotypes ou de niveaux d’expression géniques de marqueurs moléculaires, à l’échelle de quelques gènes jusqu’au génome/transcriptome. Elles font notamment appel aux technologies de séquençage haut débit et à leurs applications (metabarcoding, 16S rRNA amplicon sequencing, RADseq, Genotyping By Sequencing, RNAseq).

Mots-clés : Next Generation Sequencing, High-throughput sequencing, PCR, DNA Sequencing, Genotyping, eDNA, Ecology and Evolution, Biodiversity, Rodents, Bats, Population Genetics, Genomics, Microbiome, Pathobiome