GALAN Maxime
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Maxime GALAN

Ingénieur de recherche, INRAE

Axe(s)

Plateau(x) technique(s)

Responsabilité(s) collective(s)
Membre du Conseil d’Unité
Membre du Collectif Développement Durable
Membre du Conseil Scientifique de l’unité
Responsable équipements du plateau de Biologie Moléculaire

Mon activité principale consiste à développer et mettre en place des stratégies moléculaires d’étude de la variabilité génétique des populations naturelles de vertébrés, de leurs pathogènes ainsi que de proies associées, à partir d’échantillons invasifs ou d’ADN environnemental. Ces méthodes concernent la caractérisation de séquences nucléiques, de génotypes ou de niveaux d’expression géniques de marqueurs moléculaires, à l’échelle de quelques gènes jusqu’au génome/transcriptome. Elles font notamment appel aux technologies de séquençage haut débit et à leurs applications (metabarcoding, 16S rRNA amplicon sequencing, RADseq, Genotyping By Sequencing, RNAseq).

 

Mots-clés : Next Generation Sequencing, High-throughput sequencing, PCR, DNA Sequencing, Genotyping, eDNA, Ecology and Evolution, Biodiversity, Rodents, Bats, Population Genetics, Genomics, Microbiome, Pathobiome

Dernières publications
Bouilloud* M., Galan M., Dubois A., Diagne C., Marianneau P., Roche B. & Charbonnel N. 2023. Three-way relationships between gut microbiota, helminth assemblages and bacterial infections in wild rodent populations. Peer Community Journal 3 : e18. (https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.243)
Galan M., Bordes A., Gauthier P., Kane M., Niang Y., Pierre E. & Granjon L. 2023. The diet of commensal Crocidura olivieri (Soricomorpha: Soricidae): predation on co-existing invasive Mus musculus suggested by DNA metabarcoding data. Mammalia 87 : 326-334. (https://dx.doi.org/10.1515/mammalia-2023-0021)
Gouthier L., Duval E., Blanchet S., Loot G., Veyssière C., Galan M., Quéméré E. & Jacquin L. 2023. Spatial patterns of neutral and functional genetic variations along dendritic networks of riverscape in brown trout populations. Diversity 15 : 784. (https://dx.doi.org/10.3390/d15060784)
Zintl A., McManus A., Galan M., Diquattro M., Giuffredi L., Charbonnel N., Gray J., Holland C. & Stuart P. 2023. Presence and identity of Babesia microti in Ireland. Ticks and Tick-Borne Diseases 14 : 102221. (https://dx.doi.org/10.1016/j.ttbdis.2023.102221)
Guiver E., Galan M., Lippens C., Bellenger J., Faivre B. & Sorci G. 2022. Increasing helminth infection burden depauperates the diversity of the gut microbiota and alters its composition in mice. Current Research in Parasitology & Vector-Borne Diseases 2 : 100082. (https://dx.doi.org/10.1016/j.crpvbd.2022.100082)
Pradel J., Bouilloud* M., Loiseau A., Piry S., Galan M., Artige E., Castel G., Ferrero J., Gallet R., Thuel G., Vieira N. & Charbonnel N. 2022. Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10 : e95214. (https://dx.doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214)
Olvera-Vazquez S.G., Remoue C., Venon A., Rousselet A., Grandcolas O., Azrine M., Momont L., Galan M., Benoit L., David G., Alhmedi A., Belien T., Alins G., Franck P., Haddioui A., Jacobsen S.K., Andreev R., Simon S., Sigsgaard L., Guibert E., Tournant L., Gazel F., Mody K., Khachtib Y., Roman A., Ursu T.M., Zakharov I.A., Belcram H., Harry M., Roth M., Simon J.-C., Oram S., Ricard J.M., Agnello A., Beers E.H., Engelman J., Balti I., Salhi-Hannachi A., Zhang H., Tu H., Mottet C., Barrès B., Degrave A., Razmjou J., Giraud T., Falque M., Dapena E., Miñarro M., Jardillier L., Deschamps P., Jousselin E. & Cornille A. 2021. Large-scale geographic survey provides insights into the colonization history of a major aphid pest on its cultivated apple host in Europe, North America and North Africa. Peer Community Journal 1 : e34. (https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.26)
Quéméré E., Aucourd M., Troispoux V., Brosse S., Murienne J., Covain R., Le Bail P.Y., Olivier J., Tysklind N. & Galan M. 2021. Unraveling the dietary diversity of Neotropical top predators using scat DNA metabarcoding: A case study on the elusive Giant Otter. Environmental DNA 3 : 889-900. (https://dx.doi.org/10.1002/edn3.195)
Quéméré E., Hessenauer P., Galan M., Fernandez M., Merlet J., Chaval Y., Morellet N., Verheyden H., Gilot‐Fromont E. & Charbonnel N. 2021. Pathogen‐mediated selection favours the maintenance of innate immunity gene polymorphism in a widespread wild ungulate. Journal of Evolutionary Biology 34 : 1156-1166. (https://dx.doi.org/10.1111/jeb.13876)
Tournayre* O., Leuchtmann M., Galan M., Trillat M., Piry S., Pinaud D., Filippi‐Codaccioni O., Pontier D. & Charbonnel N. 2021. eDNA metabarcoding reveals a core and secondary diets of the greater horseshoe bat with strong spatio‐temporal plasticity. Environmental DNA 3 : 277-296. (https://dx.doi.org/10.1002/edn3.167)