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Rémi ALLIO

Chargé de recherche, INRAE

Axe(s)

Caractérisation et évolution de la biodiversité

J’étudie les liens entre les traits phénotypiques des espèces et leur histoire évolutive. Ainsi, mes recherches se basent sur l’inférence des relations de parenté entre espèces à l’aide de données génomiques (phylogénomique) et sur la comparaison et l’étude de l’évolution des génomes de ces espèces en fonction de leur(s) phénotype(s) (génomique comparative).

Condamine F.L., Allio R., Reboud E.L., Dupuis J.R., Toussaint E.F.A., Mazet N., Hu S.J., Lewis D.S., Kunte K., Cotton A.M. & Sperling F.A.H. 2023. A comprehensive phylogeny and revised taxonomy illuminate the origin and diversification of the global radiation of Papilio (Lepidoptera: Papilionidae). Molecular Phylogenetics and Evolution 183 : 107758. (https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107758)

Allio R., Nabholz B., Wanke S., Chomicki G., Pérez-Escobar O.A., Cotton A.M., Clamens A.-L., Kergoat G.J., Sperling F.A.H. & Condamine F.L. 2021. Genome-wide macroevolutionary signatures of key innovations in butterflies colonizing new host plants. Nature Communications 12 : 354. (https://dx.doi.org/10.1038/s41467-020-20507-3)

Allio R., Scornavacca C., Nabholz B., Clamens A.-L., Sperling F.A. & Condamine F.L. 2020. Whole genome shotgun phylogenomics resolves the pattern and timing of swallowtail butterfly evolution. Systematic Biology 69 : 38-60. (https://dx.doi.org/10.1093/sysbio/syz030)