CHARBONNEL N

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Nathalie CHARBONNEL

Directrice de recherche, INRAE

Axe(s)

Écologie et évolution des zoonoses

Responsabilité(s) collective(s)

Responsable de l'axe 3

Mes recherches en écologie de la santé ont pour thématique générale les interactions entre petits mammifères (rongeurs, insectivores, chirpotères) et pathogènes. Elles visent à décrire ces interactions, leur variabilité dans le temps et l’espace, et à comprendre les mécanismes écologiques qui régissent leur évolution. Dans le cadre de l’étude des zoonoses et des risques d’émergence, je m’attache à caractériser les réservoirs et les agents de zoonoses, à analyser les processus macro- et microévolutifs qui façonnent la diversité des interactions réservoirs/pathogènes, et à évaluer l’impact des coinfections et des flores microbiennes sur la sensibilité des petits mammifères à certains pathogènes potentiellement zoonotiques. Je développe ces recherches dans le cadre de projets pluri- et trans-disciplinaires afin de co-construire des stratégies de gestion des petits mammifères qui soient ‘gagnant-gagnant’ pour la conservation de la biodiversité et pour la santé publique.

Mots-clés : zoonoses, écologie de la santé, rongeurs, mammifères.

Bouilloud* M., Galan M., Dubois A., Diagne C., Marianneau P., Roche B. & Charbonnel N. 2023. Three-way relationships between gut microbiota, helminth assemblages and bacterial infections in wild rodent populations. Peer Community Journal 3 : e18. (https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.243)

Poissenot K., Moussu C., Brachet M., Chesneau D., Chemineau P., Laine A.L., Migaud M., Charbonnel N. & Keller M. 2023. Population density does not affect seasonal regulation of reproductive physiology in male water voles. Biology Letters 19 : 20220441. (https://dx.doi.org/10.1098/rsbl.2022.0441)

Zintl A., McManus A., Galan M., Diquattro M., Giuffredi L., Charbonnel N., Gray J., Holland C. & Stuart P. 2023. Presence and identity of Babesia microti in Ireland. Ticks and Tick-Borne Diseases 14 : 102221. (https://dx.doi.org/10.1016/j.ttbdis.2023.102221)

Bourret V., Dutra L., Alburkat H., Maki S., Lintunen E., Wasniewski M., Kant R., Grzybek M., Venkat V., Asad H., Pradel J., Bouilloud* M., Leirs H., Colombo V.C., Sluydts V., Stuart P., McManus A., Eccard J.A., Firozpoor J., Imholt C., Nowicka J., Goll A., Ranc N., Castel G., Charbonnel N. & Sironen T. 2022. Serologic surveillance for SARS-CoV-2 infection among wild rodents, Europe. Emerging Infectious Diseases 28 : 2577-2580. (https://dx.doi.org/10.3201/eid2812.221235)

Pradel J., Bouilloud* M., Loiseau A., Piry S., Galan M., Artige E., Castel G., Ferrero J., Gallet R., Thuel G., Vieira N. & Charbonnel N. 2022. Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10 : e95214. (https://dx.doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214)

Quéméré E., Hessenauer P., Galan M., Fernandez M., Merlet J., Chaval Y., Morellet N., Verheyden H., Gilot‐Fromont E. & Charbonnel N. 2021. Pathogen‐mediated selection favours the maintenance of innate immunity gene polymorphism in a widespread wild ungulate. Journal of Evolutionary Biology 34 : 1156-1166. (https://dx.doi.org/10.1111/jeb.13876)

Tournayre* O., Leuchtmann M., Galan M., Trillat M., Piry S., Pinaud D., Filippi‐Codaccioni O., Pontier D. & Charbonnel N. 2021. eDNA metabarcoding reveals a core and secondary diets of the greater horseshoe bat with strong spatio‐temporal plasticity. Environmental DNA 3 : 277-296. (https://dx.doi.org/10.1002/edn3.167)

Vulin J., Murri S., Madrières* S., Galan M., Tatard C., Piry S., Vaccari G., D’Agostino C., Charbonnel N., Castel G. & Marianneau P. 2021. Isolation and genetic characterization of Puumala Orthohantavirus strains from France. Pathogens 10 : 349. (https://dx.doi.org/10.3390/pathogens10030349)

Charbonnel N., Galan M., Tatard C., Loiseau A., Diagne C.A., Dalecky A., Parrinello H., Rialle S., Severac D. & Brouat C. 2020. Differential immune gene expression associated with contemporary range expansion in two invasive rodents in Senegal. Scientific Reports 10 : 18257. (https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-75060-2)

Fevola C., Rossi C., Rosso F., Girardi M., Rosa R., Manica M., Delucchi L., Rocchini D., Garzon-Lopez C.X., Arnoldi D., Bianchi A., Buzan E., Charbonnel N., Collini M., Dureje L., Ecke F., Ferrari N., Fischer S., Gillingham E.L., Hornfeldt B., Kazimirova M., Konecny A., Maas M., Magnusson M., Miller A., Niemimaa J., Nordstrom A., Obiegala A., Olsson G., Pedrini P., Pialek J., Reusken C.B., Rizzolli F., Romeo C., Silaghi C., Sironen T., Stanko M., Tagliapietra V., Ulrich R.G., Vapalahti O., Voutilainen L., Wauters L., Rizzoli A., Vaheri A., Jaaskelainen A.J., Henttonen H. & Hauffe H.C. 2020. Geographical distribution of Ljungan Virus in small mammals in Europe. Vector-Borne and Zoonotic Diseases 20 : 692-702. (https://dx.doi.org/10.1089/vbz.2019.2542)